Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TFIP11Q9UBB9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFIP11Q9UBB9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms