Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN4

EHD2, EH domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD2Q9NZN4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EHD2Q9NZN4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EHD2Q9NZN4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EHD2Q9NZN4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EHD2Q9NZN4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EHD2Q9NZN4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EHD2Q9NZN4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EHD2Q9NZN4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EHD2Q9NZN4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EHD2Q9NZN4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EHD2Q9NZN4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EHD2Q9NZN4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EHD2Q9NZN4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EHD2Q9NZN4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EHD2Q9NZN4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EHD2Q9NZN4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EHD2Q9NZN4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EHD2Q9NZN4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EHD2Q9NZN4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EHD2Q9NZN4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EHD2Q9NZN4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EHD2Q9NZN4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EHD2Q9NZN4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EHD2Q9NZN4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EHD2Q9NZN4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EHD2Q9NZN4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EHD2Q9NZN4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EHD2Q9NZN4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EHD2Q9NZN4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EHD2Q9NZN4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EHD2Q9NZN4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EHD2Q9NZN4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms