Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RDH8Q9NYR8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms