Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY43

BARHL2, BarH-like 2 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL2Q9NY43 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BARHL2Q9NY43 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms