Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXW9

ALKBH4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH4Q9NXW9 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALKBH4Q9NXW9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALKBH4Q9NXW9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALKBH4Q9NXW9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALKBH4Q9NXW9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALKBH4Q9NXW9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALKBH4Q9NXW9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALKBH4Q9NXW9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALKBH4Q9NXW9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALKBH4Q9NXW9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALKBH4Q9NXW9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALKBH4Q9NXW9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALKBH4Q9NXW9 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALKBH4Q9NXW9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALKBH4Q9NXW9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALKBH4Q9NXW9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALKBH4Q9NXW9 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALKBH4Q9NXW9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ALKBH4Q9NXW9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ALKBH4Q9NXW9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ALKBH4Q9NXW9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ALKBH4Q9NXW9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ALKBH4Q9NXW9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ALKBH4Q9NXW9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ALKBH4Q9NXW9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ALKBH4Q9NXW9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ALKBH4Q9NXW9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ALKBH4Q9NXW9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ALKBH4Q9NXW9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ALKBH4Q9NXW9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ALKBH4Q9NXW9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ALKBH4Q9NXW9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ALKBH4Q9NXW9 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ALKBH4Q9NXW9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ALKBH4Q9NXW9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ALKBH4Q9NXW9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ALKBH4Q9NXW9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ALKBH4Q9NXW9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ALKBH4Q9NXW9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ALKBH4Q9NXW9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ALKBH4Q9NXW9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ALKBH4Q9NXW9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ALKBH4Q9NXW9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ALKBH4Q9NXW9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ALKBH4Q9NXW9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ALKBH4Q9NXW9 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ALKBH4Q9NXW9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ALKBH4Q9NXW9 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ALKBH4Q9NXW9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ALKBH4Q9NXW9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ALKBH4Q9NXW9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ALKBH4Q9NXW9 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ALKBH4Q9NXW9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms