Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FBXO28Q9NVF7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO28Q9NVF7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms