Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

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Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LTBP3Q9NS15 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LTBP3Q9NS15 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LTBP3Q9NS15 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LTBP3Q9NS15 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LTBP3Q9NS15 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LTBP3Q9NS15 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LTBP3Q9NS15 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LTBP3Q9NS15 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LTBP3Q9NS15 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LTBP3Q9NS15 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LTBP3Q9NS15 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LTBP3Q9NS15 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LTBP3Q9NS15 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LTBP3Q9NS15 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LTBP3Q9NS15 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LTBP3Q9NS15 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LTBP3Q9NS15 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LTBP3Q9NS15 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LTBP3Q9NS15 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LTBP3Q9NS15 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LTBP3Q9NS15 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LTBP3Q9NS15 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LTBP3Q9NS15 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LTBP3Q9NS15 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LTBP3Q9NS15 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LTBP3Q9NS15 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LTBP3Q9NS15 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LTBP3Q9NS15 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LTBP3Q9NS15 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LTBP3Q9NS15 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LTBP3Q9NS15 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LTBP3Q9NS15 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LTBP3Q9NS15 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LTBP3Q9NS15 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LTBP3Q9NS15 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LTBP3Q9NS15 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LTBP3Q9NS15 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LTBP3Q9NS15 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LTBP3Q9NS15 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LTBP3Q9NS15 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LTBP3Q9NS15 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LTBP3Q9NS15 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LTBP3Q9NS15 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LTBP3Q9NS15 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LTBP3Q9NS15 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LTBP3Q9NS15 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LTBP3Q9NS15 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LTBP3Q9NS15 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LTBP3Q9NS15 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LTBP3Q9NS15 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LTBP3Q9NS15 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LTBP3Q9NS15 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LTBP3Q9NS15 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LTBP3Q9NS15 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LTBP3Q9NS15 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LTBP3Q9NS15 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LTBP3Q9NS15 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LTBP3Q9NS15 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LTBP3Q9NS15 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
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