Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 GUSB-210ENST00000475316 505 ntTSL 313.99□□□□□ -0.173e-8■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 RSPRY1-201ENST00000394420 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.22e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 KAT6A-208ENST00000485568 3592 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.272e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 NUCB2-208ENST00000529010 2274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.322e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 NUCB2-210ENST00000530527 1837 ntTSL 212.79□□□□□ -0.362e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 NUCB2-201ENST00000323688 1905 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.372e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 NSD2-201ENST00000312087 8050 ntTSL 1 (best)12.68□□□□□ -0.382e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 RNF216-209ENST00000484458 492 ntTSL 512.54□□□□□ -0.42e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 NSD2-212ENST00000503128 8568 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.432e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 NSD2-202ENST00000353275 7980 ntTSL 1 (best)12.25□□□□□ -0.452e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 RNF216-201ENST00000389900 3104 ntTSL 1 (best)12.2□□□□□ -0.462e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 NSD2-221ENST00000511904 690 ntTSL 512.09□□□□□ -0.472e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 UBP1-213ENST00000496310 544 ntTSL 411.67□□□□□ -0.545e-10■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 NSD2-207ENST00000398261 8390 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.572e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 NSD2-205ENST00000382892 7706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.62e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 NSD2-211ENST00000502425 421 ntTSL 310.51□□□□□ -0.732e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 KAT6A-203ENST00000406337 9241 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.882e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 LIMD1-201ENST00000273317 11331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.922e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 KAT6A-201ENST00000265713 9153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.982e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 FBXW2-205ENST00000608872 9138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.082e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 KAT6A-202ENST00000396930 9285 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.172e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 NUCB2-217ENST00000533773 1839 ntTSL 55.16□□□□□ -1.582e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.592e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 NUCB2-204ENST00000526120 496 ntTSL 1 (best)3.89□□□□□ -1.792e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 ASPSCR1-216ENST00000583503 641 ntTSL 327.99■■■□□ 2.072e-8■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.183e-7■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 SLC31A1-202ENST00000496650 475 ntTSL 214.06□□□□□ -0.165e-7■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 SLC31A1-201ENST00000374212 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.435e-7■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 SLC25A10-207ENST00000574129 1523 ntTSL 547.38■■■■■ 5.172e-8■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.512e-8■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.522e-8■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.173e-7■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 KLF3-AS1-201ENST00000436901 1896 ntTSL 233■■■□□ 2.873e-7■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 AL121845.3-202ENST00000632538 872 ntAPPRIS P1 TSL 332.3■■■□□ 2.769e-11■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 SDC1-205ENST00000447124 591 ntTSL 432.12■■■□□ 2.739e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.679e-11■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.659e-11■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.552e-8■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.539e-11■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 ZGPAT-208ENST00000472711 787 ntTSL 330.76■■■□□ 2.519e-11■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.329e-11■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 AKT1-205ENST00000553506 2830 ntTSL 228.86■■■□□ 2.215e-8■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.069e-11■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 ZGPAT-211ENST00000484569 749 ntTSL 227.78■■■□□ 2.049e-11■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.989e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 ZGPAT-210ENST00000478385 935 ntTSL 226.63■■□□□ 1.859e-11■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.369e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 SDC1-204ENST00000429035 646 ntTSL 322.78■■□□□ 1.249e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 ZGPAT-209ENST00000477340 2831 ntTSL 222.77■■□□□ 1.249e-11■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.233e-7■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.233e-7■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.189e-11■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.121e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 PLEKHA7-206ENST00000525781 2391 ntTSL 220.79■□□□□ 0.929e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.749e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 KLF3-AS1-206ENST00000610668 685 ntTSL 219.22■□□□□ 0.673e-7■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.649e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 KLF3-AS1-205ENST00000507091 642 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.453e-7■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 PLEKHA7-218ENST00000636113 2981 ntTSL 517.05■□□□□ 0.329e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.39e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 PLEKHA7-211ENST00000531066 4561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.039e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 PLEKHA7-210ENST00000530489 3688 ntTSL 1 (best)14.54□□□□□ -0.089e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 PLEKHA7-219ENST00000637162 3602 ntTSL 514.49□□□□□ -0.099e-6■■■■□ 19.8
DROSHAQ9NRR4 B4GALNT4-204ENST00000530717 409 ntTSL 329.01■■■□□ 2.231e-6■■■■□ 19.7
DROSHAQ9NRR4 RBSN-205ENST00000449964 1132 ntTSL 530.91■■■□□ 2.545e-18■■■■□ 19.7
DROSHAQ9NRR4 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.435e-18■■■■□ 19.7
DROSHAQ9NRR4 RBSN-206ENST00000463214 591 ntTSL 217.49■□□□□ 0.395e-18■■■■□ 19.7
DROSHAQ9NRR4 RBSN-201ENST00000253699 6678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.515e-18■■■■□ 19.7
DROSHAQ9NRR4 AHNAK-207ENST00000531324 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 328.62■■■□□ 2.179e-8■■■■□ 19.7
DROSHAQ9NRR4 AHNAK-206ENST00000530285 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 320.99■□□□□ 0.959e-8■■■■□ 19.7
DROSHAQ9NRR4 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.022e-6■■■■□ 19.7
DROSHAQ9NRR4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.117e-7■■■■□ 19.7
DROSHAQ9NRR4 NINL-204ENST00000461642 594 ntTSL 322.92■■□□□ 1.261e-6■■■■□ 19.7
DROSHAQ9NRR4 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.111e-6■■■■□ 19.7
DROSHAQ9NRR4 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.61e-6■■■■□ 19.7
DROSHAQ9NRR4 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.452e-7■■■■□ 19.7
DROSHAQ9NRR4 NDUFB7-202ENST00000593353 529 ntTSL 224.08■■□□□ 1.452e-7■■■■□ 19.7
DROSHAQ9NRR4 WDR1-214ENST00000509695 467 ntTSL 422.22■■□□□ 1.155e-6■■■■□ 19.7
DROSHAQ9NRR4 HNRNPH1-218ENST00000510678 1996 ntTSL 520.76■□□□□ 0.912e-29■■■■□ 19.7
DROSHAQ9NRR4 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.812e-29■■■■□ 19.7
DROSHAQ9NRR4 HNRNPH1-237ENST00000520415 620 ntTSL 319.37■□□□□ 0.692e-29■■■■□ 19.7
DROSHAQ9NRR4 HNRNPH1-216ENST00000510411 2105 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.622e-29■■■■□ 19.7
DROSHAQ9NRR4 HNRNPH1-236ENST00000519958 885 ntTSL 518.62■□□□□ 0.572e-29■■■■□ 19.7
DROSHAQ9NRR4 HNRNPH1-239ENST00000521173 831 ntTSL 516.5■□□□□ 0.232e-29■■■■□ 19.7
DROSHAQ9NRR4 HNRNPH1-227ENST00000515481 5564 ntTSL 28.82□□□□□ -12e-29■■■■□ 19.7
DROSHAQ9NRR4 HNRNPH1-229ENST00000518548 527 ntTSL 23.3□□□□□ -1.882e-29■■■■□ 19.7
DROSHAQ9NRR4 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.94e-6■■■■□ 19.6
DROSHAQ9NRR4 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.234e-6■■■■□ 19.6
DROSHAQ9NRR4 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.964e-6■■■■□ 19.6
DROSHAQ9NRR4 WDR1-211ENST00000508079 812 ntTSL 318.93■□□□□ 0.624e-6■■■■□ 19.6
DROSHAQ9NRR4 WDR1-204ENST00000499869 3054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.194e-6■■■■□ 19.6
DROSHAQ9NRR4 AMD1-201ENST00000368876 3040 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.125e-6■■■■□ 19.6
DROSHAQ9NRR4 AMD1-202ENST00000368877 1605 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.335e-6■■■■□ 19.6
DROSHAQ9NRR4 AMD1-203ENST00000368882 3059 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.925e-6■■■■□ 19.6
DROSHAQ9NRR4 AMD1-205ENST00000451850 3121 ntTSL 1 (best)8.34□□□□□ -1.075e-6■■■■□ 19.6
DROSHAQ9NRR4 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.215e-6■■■■□ 19.6
DROSHAQ9NRR4 ATP11A-205ENST00000419448 435 ntTSL 312.17□□□□□ -0.464e-7■■■■□ 19.6
DROSHAQ9NRR4 NR1H2-208ENST00000597157 856 ntTSL 1 (best)25.27■■□□□ 1.641e-14■■■■□ 19.6
DROSHAQ9NRR4 NADSYN1-222ENST00000534634 963 ntTSL 223.61■■□□□ 1.374e-10■■■■□ 19.6
DROSHAQ9NRR4 UBE2I-210ENST00000562482 735 ntTSL 225.05■■□□□ 1.65e-7■■■■□ 19.6
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