Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ3

CCL28, C-C motif chemokine 28, humanhuman

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL28Q9NRJ3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCL28Q9NRJ3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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