Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SH2B1Q9NRF2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SH2B1Q9NRF2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms