Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRC9

OTOR, Otoraplin, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTORQ9NRC9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTORQ9NRC9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms