Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RTN4Q9NQC3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RTN4Q9NQC3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms