Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NRIP3Q9NQ35 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NRIP3Q9NQ35 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms