Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B4

SMYD3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3Q9H7B4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMYD3Q9H7B4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms