Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC8Q9H0W5 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms