Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXR3

ERVK-6, Endogenous retrovirus group K member 6 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-6Q9BXR3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ERVK-6Q9BXR3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVK-6Q9BXR3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVK-6Q9BXR3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVK-6Q9BXR3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVK-6Q9BXR3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVK-6Q9BXR3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVK-6Q9BXR3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVK-6Q9BXR3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms