Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VN1R3Q9BXE9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms