Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SYCP2Q9BX26 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SYCP2Q9BX26 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SYCP2Q9BX26 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SYCP2Q9BX26 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SYCP2Q9BX26 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SYCP2Q9BX26 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SYCP2Q9BX26 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SYCP2Q9BX26 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SYCP2Q9BX26 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SYCP2Q9BX26 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SYCP2Q9BX26 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SYCP2Q9BX26 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SYCP2Q9BX26 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SYCP2Q9BX26 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SYCP2Q9BX26 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SYCP2Q9BX26 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SYCP2Q9BX26 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SYCP2Q9BX26 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SYCP2Q9BX26 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
SYCP2Q9BX26 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SYCP2Q9BX26 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SYCP2Q9BX26 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SYCP2Q9BX26 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SYCP2Q9BX26 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SYCP2Q9BX26 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SYCP2Q9BX26 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SYCP2Q9BX26 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SYCP2Q9BX26 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SYCP2Q9BX26 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SYCP2Q9BX26 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SYCP2Q9BX26 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SYCP2Q9BX26 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SYCP2Q9BX26 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SYCP2Q9BX26 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SYCP2Q9BX26 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SYCP2Q9BX26 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SYCP2Q9BX26 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
SYCP2Q9BX26 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SYCP2Q9BX26 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
SYCP2Q9BX26 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SYCP2Q9BX26 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms