Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RIOK2Q9BVS4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RIOK2Q9BVS4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
RIOK2Q9BVS4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RIOK2Q9BVS4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RIOK2Q9BVS4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
RIOK2Q9BVS4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RIOK2Q9BVS4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RIOK2Q9BVS4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RIOK2Q9BVS4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RIOK2Q9BVS4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RIOK2Q9BVS4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RIOK2Q9BVS4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RIOK2Q9BVS4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RIOK2Q9BVS4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RIOK2Q9BVS4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RIOK2Q9BVS4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RIOK2Q9BVS4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RIOK2Q9BVS4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RIOK2Q9BVS4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RIOK2Q9BVS4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RIOK2Q9BVS4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RIOK2Q9BVS4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RIOK2Q9BVS4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RIOK2Q9BVS4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RIOK2Q9BVS4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RIOK2Q9BVS4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RIOK2Q9BVS4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RIOK2Q9BVS4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RIOK2Q9BVS4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RIOK2Q9BVS4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RIOK2Q9BVS4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RIOK2Q9BVS4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RIOK2Q9BVS4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RIOK2Q9BVS4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIOK2Q9BVS4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIOK2Q9BVS4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIOK2Q9BVS4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIOK2Q9BVS4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIOK2Q9BVS4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIOK2Q9BVS4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIOK2Q9BVS4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIOK2Q9BVS4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIOK2Q9BVS4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RIOK2Q9BVS4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIOK2Q9BVS4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RIOK2Q9BVS4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIOK2Q9BVS4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIOK2Q9BVS4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIOK2Q9BVS4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIOK2Q9BVS4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms