Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAGR1Q9BTK6 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAGR1Q9BTK6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms