Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
THUMPD2Q9BTF0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
THUMPD2Q9BTF0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms