Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RTKNQ9BST9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RTKNQ9BST9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RTKNQ9BST9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RTKNQ9BST9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RTKNQ9BST9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RTKNQ9BST9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RTKNQ9BST9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RTKNQ9BST9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RTKNQ9BST9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RTKNQ9BST9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
RTKNQ9BST9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RTKNQ9BST9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RTKNQ9BST9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RTKNQ9BST9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
RTKNQ9BST9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RTKNQ9BST9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RTKNQ9BST9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RTKNQ9BST9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RTKNQ9BST9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RTKNQ9BST9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RTKNQ9BST9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RTKNQ9BST9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RTKNQ9BST9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RTKNQ9BST9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RTKNQ9BST9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RTKNQ9BST9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RTKNQ9BST9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RTKNQ9BST9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RTKNQ9BST9 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RTKNQ9BST9 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RTKNQ9BST9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RTKNQ9BST9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RTKNQ9BST9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RTKNQ9BST9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RTKNQ9BST9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RTKNQ9BST9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RTKNQ9BST9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RTKNQ9BST9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RTKNQ9BST9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RTKNQ9BST9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RTKNQ9BST9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RTKNQ9BST9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RTKNQ9BST9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RTKNQ9BST9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RTKNQ9BST9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RTKNQ9BST9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms