Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS2

RIOK1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK1Q9BRS2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RIOK1Q9BRS2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms