Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPN18Q99952 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN18Q99952 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN18Q99952 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN18Q99952 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN18Q99952 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN18Q99952 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN18Q99952 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN18Q99952 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN18Q99952 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN18Q99952 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN18Q99952 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN18Q99952 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN18Q99952 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN18Q99952 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN18Q99952 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN18Q99952 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN18Q99952 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN18Q99952 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN18Q99952 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN18Q99952 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms