Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
ARID3AQ99856 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID3AQ99856 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms