Protein–RNA interactions for Protein: Q99816

TSG101, Tumor susceptibility gene 101 protein, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSG101Q99816 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSG101Q99816 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSG101Q99816 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSG101Q99816 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSG101Q99816 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSG101Q99816 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSG101Q99816 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSG101Q99816 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSG101Q99816 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSG101Q99816 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSG101Q99816 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSG101Q99816 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSG101Q99816 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSG101Q99816 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSG101Q99816 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSG101Q99816 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSG101Q99816 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSG101Q99816 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSG101Q99816 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSG101Q99816 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSG101Q99816 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSG101Q99816 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSG101Q99816 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSG101Q99816 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms