Protein–RNA interactions for Protein: Q99758

ABCA3, ATP-binding cassette sub-family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCA3Q99758 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ABCA3Q99758 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ABCA3Q99758 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ABCA3Q99758 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ABCA3Q99758 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ABCA3Q99758 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ABCA3Q99758 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ABCA3Q99758 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ABCA3Q99758 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ABCA3Q99758 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ABCA3Q99758 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms