Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PITX2Q99697 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms