Protein–RNA interactions for Protein: Q99459

CDC5L, Cell division cycle 5-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC5LQ99459 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC5LQ99459 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms