Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NAP1L3Q99457 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NAP1L3Q99457 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms