Protein–RNA interactions for Protein: Q96T66

NMNAT3, Nicotinamide/nicotinic acid mononucleotide adenylyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMNAT3Q96T66 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMNAT3Q96T66 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMNAT3Q96T66 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMNAT3Q96T66 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMNAT3Q96T66 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMNAT3Q96T66 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMNAT3Q96T66 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMNAT3Q96T66 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMNAT3Q96T66 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMNAT3Q96T66 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMNAT3Q96T66 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMNAT3Q96T66 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMNAT3Q96T66 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMNAT3Q96T66 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMNAT3Q96T66 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMNAT3Q96T66 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMNAT3Q96T66 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMNAT3Q96T66 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMNAT3Q96T66 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMNAT3Q96T66 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NMNAT3Q96T66 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMNAT3Q96T66 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMNAT3Q96T66 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMNAT3Q96T66 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMNAT3Q96T66 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMNAT3Q96T66 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMNAT3Q96T66 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMNAT3Q96T66 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMNAT3Q96T66 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMNAT3Q96T66 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMNAT3Q96T66 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMNAT3Q96T66 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMNAT3Q96T66 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMNAT3Q96T66 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMNAT3Q96T66 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMNAT3Q96T66 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMNAT3Q96T66 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMNAT3Q96T66 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMNAT3Q96T66 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMNAT3Q96T66 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMNAT3Q96T66 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NMNAT3Q96T66 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NMNAT3Q96T66 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMNAT3Q96T66 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMNAT3Q96T66 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NMNAT3Q96T66 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMNAT3Q96T66 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMNAT3Q96T66 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMNAT3Q96T66 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMNAT3Q96T66 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMNAT3Q96T66 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMNAT3Q96T66 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMNAT3Q96T66 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMNAT3Q96T66 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMNAT3Q96T66 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NMNAT3Q96T66 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NMNAT3Q96T66 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NMNAT3Q96T66 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NMNAT3Q96T66 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NMNAT3Q96T66 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NMNAT3Q96T66 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NMNAT3Q96T66 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NMNAT3Q96T66 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NMNAT3Q96T66 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NMNAT3Q96T66 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NMNAT3Q96T66 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NMNAT3Q96T66 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NMNAT3Q96T66 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NMNAT3Q96T66 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NMNAT3Q96T66 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NMNAT3Q96T66 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NMNAT3Q96T66 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NMNAT3Q96T66 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NMNAT3Q96T66 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NMNAT3Q96T66 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NMNAT3Q96T66 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NMNAT3Q96T66 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NMNAT3Q96T66 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NMNAT3Q96T66 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NMNAT3Q96T66 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NMNAT3Q96T66 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NMNAT3Q96T66 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NMNAT3Q96T66 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NMNAT3Q96T66 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NMNAT3Q96T66 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NMNAT3Q96T66 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NMNAT3Q96T66 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NMNAT3Q96T66 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NMNAT3Q96T66 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NMNAT3Q96T66 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NMNAT3Q96T66 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NMNAT3Q96T66 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NMNAT3Q96T66 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NMNAT3Q96T66 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NMNAT3Q96T66 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NMNAT3Q96T66 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NMNAT3Q96T66 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NMNAT3Q96T66 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NMNAT3Q96T66 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NMNAT3Q96T66 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms