Protein–RNA interactions for Protein: Q96T51

RUFY1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY1Q96T51 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RUFY1Q96T51 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms