Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX18Q96RF0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms