Protein–RNA interactions for Protein: Q96QU6

ACCS, 1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACCSQ96QU6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACCSQ96QU6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACCSQ96QU6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACCSQ96QU6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACCSQ96QU6 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACCSQ96QU6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACCSQ96QU6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACCSQ96QU6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACCSQ96QU6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACCSQ96QU6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACCSQ96QU6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACCSQ96QU6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACCSQ96QU6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms