Protein–RNA interactions for Protein: Q96QA5

GSDMA, Gasdermin-A, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMAQ96QA5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GSDMAQ96QA5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSDMAQ96QA5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSDMAQ96QA5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSDMAQ96QA5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSDMAQ96QA5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSDMAQ96QA5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSDMAQ96QA5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSDMAQ96QA5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSDMAQ96QA5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSDMAQ96QA5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSDMAQ96QA5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSDMAQ96QA5 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSDMAQ96QA5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSDMAQ96QA5 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSDMAQ96QA5 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GSDMAQ96QA5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSDMAQ96QA5 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSDMAQ96QA5 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSDMAQ96QA5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSDMAQ96QA5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSDMAQ96QA5 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSDMAQ96QA5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSDMAQ96QA5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSDMAQ96QA5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSDMAQ96QA5 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSDMAQ96QA5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSDMAQ96QA5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSDMAQ96QA5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GSDMAQ96QA5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSDMAQ96QA5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSDMAQ96QA5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSDMAQ96QA5 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSDMAQ96QA5 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSDMAQ96QA5 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSDMAQ96QA5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSDMAQ96QA5 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSDMAQ96QA5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSDMAQ96QA5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSDMAQ96QA5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSDMAQ96QA5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSDMAQ96QA5 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSDMAQ96QA5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GSDMAQ96QA5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSDMAQ96QA5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSDMAQ96QA5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GSDMAQ96QA5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSDMAQ96QA5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSDMAQ96QA5 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GSDMAQ96QA5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSDMAQ96QA5 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSDMAQ96QA5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSDMAQ96QA5 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GSDMAQ96QA5 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSDMAQ96QA5 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSDMAQ96QA5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSDMAQ96QA5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSDMAQ96QA5 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSDMAQ96QA5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GSDMAQ96QA5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSDMAQ96QA5 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSDMAQ96QA5 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSDMAQ96QA5 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSDMAQ96QA5 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSDMAQ96QA5 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSDMAQ96QA5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSDMAQ96QA5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSDMAQ96QA5 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSDMAQ96QA5 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSDMAQ96QA5 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSDMAQ96QA5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms