Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT0

CCDC115, Coiled-coil domain-containing protein 115, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC115Q96NT0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC115Q96NT0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms