Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL0

RUNDC3B, RUN domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3BQ96NL0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RUNDC3BQ96NL0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms