Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
FAM20AQ96MK3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM20AQ96MK3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms