Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
JSRP1Q96MG2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
JSRP1Q96MG2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms