Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC17Q96LX7 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC17Q96LX7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms