Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW4

PRIMPOL, DNA-directed primase/polymerase protein, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIMPOLQ96LW4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRIMPOLQ96LW4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRIMPOLQ96LW4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRIMPOLQ96LW4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRIMPOLQ96LW4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRIMPOLQ96LW4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PRIMPOLQ96LW4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRIMPOLQ96LW4 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRIMPOLQ96LW4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRIMPOLQ96LW4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRIMPOLQ96LW4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRIMPOLQ96LW4 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRIMPOLQ96LW4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRIMPOLQ96LW4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRIMPOLQ96LW4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRIMPOLQ96LW4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PRIMPOLQ96LW4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PRIMPOLQ96LW4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRIMPOLQ96LW4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRIMPOLQ96LW4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRIMPOLQ96LW4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRIMPOLQ96LW4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRIMPOLQ96LW4 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRIMPOLQ96LW4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRIMPOLQ96LW4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRIMPOLQ96LW4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRIMPOLQ96LW4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRIMPOLQ96LW4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PRIMPOLQ96LW4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRIMPOLQ96LW4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRIMPOLQ96LW4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PRIMPOLQ96LW4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRIMPOLQ96LW4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRIMPOLQ96LW4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRIMPOLQ96LW4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRIMPOLQ96LW4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRIMPOLQ96LW4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRIMPOLQ96LW4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRIMPOLQ96LW4 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRIMPOLQ96LW4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRIMPOLQ96LW4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRIMPOLQ96LW4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRIMPOLQ96LW4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRIMPOLQ96LW4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRIMPOLQ96LW4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRIMPOLQ96LW4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRIMPOLQ96LW4 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRIMPOLQ96LW4 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRIMPOLQ96LW4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRIMPOLQ96LW4 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRIMPOLQ96LW4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRIMPOLQ96LW4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PRIMPOLQ96LW4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRIMPOLQ96LW4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRIMPOLQ96LW4 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRIMPOLQ96LW4 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRIMPOLQ96LW4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRIMPOLQ96LW4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRIMPOLQ96LW4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRIMPOLQ96LW4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRIMPOLQ96LW4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRIMPOLQ96LW4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRIMPOLQ96LW4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRIMPOLQ96LW4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRIMPOLQ96LW4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PRIMPOLQ96LW4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRIMPOLQ96LW4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRIMPOLQ96LW4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRIMPOLQ96LW4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRIMPOLQ96LW4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRIMPOLQ96LW4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRIMPOLQ96LW4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRIMPOLQ96LW4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PRIMPOLQ96LW4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRIMPOLQ96LW4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRIMPOLQ96LW4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PRIMPOLQ96LW4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRIMPOLQ96LW4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRIMPOLQ96LW4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRIMPOLQ96LW4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRIMPOLQ96LW4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRIMPOLQ96LW4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRIMPOLQ96LW4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRIMPOLQ96LW4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRIMPOLQ96LW4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRIMPOLQ96LW4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRIMPOLQ96LW4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRIMPOLQ96LW4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRIMPOLQ96LW4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PRIMPOLQ96LW4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRIMPOLQ96LW4 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRIMPOLQ96LW4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRIMPOLQ96LW4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRIMPOLQ96LW4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRIMPOLQ96LW4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRIMPOLQ96LW4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRIMPOLQ96LW4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRIMPOLQ96LW4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRIMPOLQ96LW4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRIMPOLQ96LW4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms