Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms