Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GJD4Q96KN9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
GJD4Q96KN9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GJD4Q96KN9 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GJD4Q96KN9 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GJD4Q96KN9 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GJD4Q96KN9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
GJD4Q96KN9 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
GJD4Q96KN9 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GJD4Q96KN9 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
GJD4Q96KN9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GJD4Q96KN9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GJD4Q96KN9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GJD4Q96KN9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GJD4Q96KN9 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GJD4Q96KN9 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GJD4Q96KN9 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GJD4Q96KN9 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GJD4Q96KN9 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
GJD4Q96KN9 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GJD4Q96KN9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GJD4Q96KN9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GJD4Q96KN9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GJD4Q96KN9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GJD4Q96KN9 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GJD4Q96KN9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GJD4Q96KN9 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GJD4Q96KN9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GJD4Q96KN9 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GJD4Q96KN9 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GJD4Q96KN9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GJD4Q96KN9 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GJD4Q96KN9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GJD4Q96KN9 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GJD4Q96KN9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
GJD4Q96KN9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GJD4Q96KN9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GJD4Q96KN9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GJD4Q96KN9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GJD4Q96KN9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GJD4Q96KN9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GJD4Q96KN9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms