Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CELF6Q96J87 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms