Protein–RNA interactions for Protein: Q96IS3

RAX2, Retina and anterior neural fold homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAX2Q96IS3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms