Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 LMO3-212ENST00000535535 1488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 HMGB1P8-201ENST00000558211 949 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 AL031058.1-201ENST00000561592 888 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 CSNK1A1-209ENST00000606299 1075 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms