Protein–RNA interactions for Protein: Q96G79

SLC35A4, Probable UDP-sugar transporter protein SLC35A4, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A4Q96G79 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC35A4Q96G79 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC35A4Q96G79 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC35A4Q96G79 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC35A4Q96G79 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC35A4Q96G79 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC35A4Q96G79 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC35A4Q96G79 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC35A4Q96G79 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC35A4Q96G79 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC35A4Q96G79 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC35A4Q96G79 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC35A4Q96G79 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC35A4Q96G79 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC35A4Q96G79 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC35A4Q96G79 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC35A4Q96G79 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC35A4Q96G79 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC35A4Q96G79 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC35A4Q96G79 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC35A4Q96G79 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC35A4Q96G79 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC35A4Q96G79 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC35A4Q96G79 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC35A4Q96G79 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC35A4Q96G79 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC35A4Q96G79 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC35A4Q96G79 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC35A4Q96G79 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC35A4Q96G79 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC35A4Q96G79 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC35A4Q96G79 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC35A4Q96G79 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC35A4Q96G79 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC35A4Q96G79 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC35A4Q96G79 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC35A4Q96G79 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC35A4Q96G79 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC35A4Q96G79 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC35A4Q96G79 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC35A4Q96G79 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC35A4Q96G79 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC35A4Q96G79 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC35A4Q96G79 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC35A4Q96G79 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC35A4Q96G79 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC35A4Q96G79 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC35A4Q96G79 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC35A4Q96G79 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC35A4Q96G79 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC35A4Q96G79 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC35A4Q96G79 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC35A4Q96G79 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC35A4Q96G79 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC35A4Q96G79 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC35A4Q96G79 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC35A4Q96G79 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC35A4Q96G79 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC35A4Q96G79 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC35A4Q96G79 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC35A4Q96G79 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC35A4Q96G79 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC35A4Q96G79 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC35A4Q96G79 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC35A4Q96G79 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC35A4Q96G79 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC35A4Q96G79 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC35A4Q96G79 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC35A4Q96G79 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC35A4Q96G79 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC35A4Q96G79 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC35A4Q96G79 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC35A4Q96G79 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC35A4Q96G79 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC35A4Q96G79 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC35A4Q96G79 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC35A4Q96G79 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC35A4Q96G79 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC35A4Q96G79 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC35A4Q96G79 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC35A4Q96G79 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC35A4Q96G79 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC35A4Q96G79 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC35A4Q96G79 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC35A4Q96G79 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC35A4Q96G79 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SLC35A4Q96G79 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC35A4Q96G79 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC35A4Q96G79 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC35A4Q96G79 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC35A4Q96G79 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC35A4Q96G79 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC35A4Q96G79 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC35A4Q96G79 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC35A4Q96G79 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC35A4Q96G79 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC35A4Q96G79 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC35A4Q96G79 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC35A4Q96G79 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC35A4Q96G79 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms