Protein–RNA interactions for Protein: Q96CJ1

EAF2, ELL-associated factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF2Q96CJ1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EAF2Q96CJ1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
EAF2Q96CJ1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EAF2Q96CJ1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EAF2Q96CJ1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EAF2Q96CJ1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
EAF2Q96CJ1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EAF2Q96CJ1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EAF2Q96CJ1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EAF2Q96CJ1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EAF2Q96CJ1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EAF2Q96CJ1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EAF2Q96CJ1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EAF2Q96CJ1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EAF2Q96CJ1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EAF2Q96CJ1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EAF2Q96CJ1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EAF2Q96CJ1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EAF2Q96CJ1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
EAF2Q96CJ1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms