Protein–RNA interactions for Protein: Q96C24

SYTL4, Synaptotagmin-like protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL4Q96C24 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYTL4Q96C24 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SYTL4Q96C24 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYTL4Q96C24 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYTL4Q96C24 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYTL4Q96C24 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYTL4Q96C24 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYTL4Q96C24 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYTL4Q96C24 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYTL4Q96C24 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYTL4Q96C24 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SYTL4Q96C24 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYTL4Q96C24 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYTL4Q96C24 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYTL4Q96C24 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYTL4Q96C24 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYTL4Q96C24 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYTL4Q96C24 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYTL4Q96C24 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYTL4Q96C24 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYTL4Q96C24 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYTL4Q96C24 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYTL4Q96C24 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYTL4Q96C24 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYTL4Q96C24 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYTL4Q96C24 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYTL4Q96C24 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SYTL4Q96C24 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYTL4Q96C24 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYTL4Q96C24 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYTL4Q96C24 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYTL4Q96C24 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYTL4Q96C24 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYTL4Q96C24 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYTL4Q96C24 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYTL4Q96C24 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYTL4Q96C24 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYTL4Q96C24 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYTL4Q96C24 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SYTL4Q96C24 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYTL4Q96C24 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYTL4Q96C24 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYTL4Q96C24 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYTL4Q96C24 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYTL4Q96C24 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYTL4Q96C24 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms