Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMIGD2Q96BF3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMIGD2Q96BF3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMIGD2Q96BF3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TMIGD2Q96BF3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMIGD2Q96BF3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMIGD2Q96BF3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMIGD2Q96BF3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMIGD2Q96BF3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMIGD2Q96BF3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TMIGD2Q96BF3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMIGD2Q96BF3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIGD2Q96BF3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIGD2Q96BF3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIGD2Q96BF3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIGD2Q96BF3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIGD2Q96BF3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIGD2Q96BF3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIGD2Q96BF3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIGD2Q96BF3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIGD2Q96BF3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIGD2Q96BF3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIGD2Q96BF3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIGD2Q96BF3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIGD2Q96BF3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIGD2Q96BF3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIGD2Q96BF3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIGD2Q96BF3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIGD2Q96BF3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIGD2Q96BF3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIGD2Q96BF3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIGD2Q96BF3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIGD2Q96BF3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIGD2Q96BF3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIGD2Q96BF3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIGD2Q96BF3 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIGD2Q96BF3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIGD2Q96BF3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIGD2Q96BF3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIGD2Q96BF3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIGD2Q96BF3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIGD2Q96BF3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIGD2Q96BF3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIGD2Q96BF3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIGD2Q96BF3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIGD2Q96BF3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIGD2Q96BF3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIGD2Q96BF3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIGD2Q96BF3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIGD2Q96BF3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIGD2Q96BF3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIGD2Q96BF3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIGD2Q96BF3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms